Comptabilité Auto-Entrepreneur 2026 : Obligations et Logiciels
L'auto-entrepreneur (micro-entrepreneur) bénéficie d'obligations comptables allégées par rapport aux sociétés. Pas de bilan, pas de liasse fiscale, mais un livre des recettes obligatoire, des factures conformes et une déclaration de chiffre d'affaires mensuelle ou trimestrielle. Un logiciel adapté simplifie ces obligations et vous met en conformité.
Les obligations comptables de l'auto-entrepreneur
L'auto-entrepreneur doit tenir un livre des recettes chronologique mentionnant le montant, l'origine, le mode de règlement et la référence de la pièce justificative. Si vous exercez une activité d'achat-revente, un registre des achats est aussi obligatoire. Vous devez émettre des factures conformes (mentions légales, numérotation chronologique) et déclarer votre CA mensuellement ou trimestriellement sur le site de l'URSSAF.
Le livre des recettes doit être tenu de manière chronologique, sans blanc ni rature. Un logiciel comme Tiime le génère automatiquement à partir de vos factures.
Logiciel gratuit ou payant ?
Pour un auto-entrepreneur avec peu de factures (<50/mois), un logiciel gratuit comme Tiime, Henrri ou l'offre Free de Sinao peut suffire. Si vous dépassez 50 factures par mois, gérez des achats ou approchez les seuils de TVA, comparez les fonctions réellement incluses : pour un indépendant, Sinao Standard démarre à 25 EUR HT/mois en facturation annuelle.
TVA et seuils : quand ça se complique
En 2026, les seuils de franchise de TVA sont de 36 800 EUR pour les prestations de services et 91 900 EUR pour l'achat-revente. Si vous dépassez ces seuils, vous devez facturer la TVA, la déclarer et la reverser. Votre logiciel doit alors gérer la TVA collectée et déductible. C'est le moment de passer à un logiciel comme Indy ou Pennylane qui automatisent la TVA.
Surveillez vos seuils de TVA en temps réel. Un dépassement non détecté à temps peut entraîner des régularisations rétroactives coûteuses. Indy et Pennylane affichent une alerte automatique quand vous approchez des seuils.
Passage en société : anticiper la transition
Si votre activité croît, vous passerez en EURL, SASU ou SARL. Choisir dès le départ un logiciel qui gère aussi les sociétés (Pennylane, Sage, EBP) évite une migration douloureuse. Vos historiques de facturation et vos contacts seront conservés.
Points clés à retenir
- •L'auto-entrepreneur doit tenir un livre des recettes chronologique et émettre des factures conformes aux mentions légales obligatoires.
- •Pour moins de 50 factures par mois, un logiciel gratuit comme Tiime ou Henrri suffit amplement.
- •En 2026, les seuils de franchise de TVA sont de 36 800 EUR (services) et 91 900 EUR (achat-revente).
- •Choisir dès le départ un logiciel compatible sociétés (Pennylane, Sage) évite une migration douloureuse lors du passage en EURL ou SASU.
- •La déclaration URSSAF de chiffre d'affaires est mensuelle ou trimestrielle — un logiciel adapté la prépare automatiquement.
Logiciels recommandés
Indy
FRLa comptabilité automatique pour les indépendants
Tiime
FRL'application comptable gratuite pour les indépendants
Pennylane
FRLa comptabilité collaborative pour les PME et leurs experts-comptables
Sinao
FRLa gestion et la préparation comptable des petites entreprises